在跨境运输中，特种集装箱因其特殊用途和性质，往往需要额外申报许可才能合规运输。以下是常见的需要申报许可的特种集装箱类型：

1. 危险品集装箱：运输易燃、易爆、有毒或腐蚀性物质的集装箱，必须向海关和运输部门申报，并提供相关安全证明文件。

2. 冷藏集装箱：用于运输需恒温保存的货物（如食品、药品），需申报温度要求及设备合规性证明。

3. 开顶集装箱：因装卸方式特殊，需申报货物尺寸和装卸方案，确保运输安全。

4. 框架集装箱：运输超大型或重型货物时，需申报货物尺寸、重量及固定方案。

5. 动物集装箱：运输活体动物需提供检疫证明和动物福利相关文件。

未按规定申报可能导致货物滞留、罚款甚至法律风险。建议提前了解目的地国家的法规要求，确保运输顺利。